Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Shroom4Q1W617 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Shroom4Q1W617 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms