Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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