Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms