Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Spta1P08032 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms