Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm28038F7BCN9 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms