Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms