Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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