Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms