Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp29Q9ES63 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms