Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Atg3Q9CPX6 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg3Q9CPX6 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Atg3Q9CPX6 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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