Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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Cldn16Q925N4 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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Cldn16Q925N4 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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