Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms