Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms