Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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