Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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