Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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