Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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