Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Gli1P47806 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Gli1P47806 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Gli1P47806 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Gli1P47806 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Gli1P47806 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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