Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SrprbP47758 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SrprbP47758 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SrprbP47758 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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