Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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Rpl28P41105 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Rpl28P41105 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Rpl28P41105 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Rpl28P41105 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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Rpl28P41105 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rpl28P41105 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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