Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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RxraP28700 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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