Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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