Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn16Q925N4 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn16Q925N4 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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