Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms