Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms