Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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