Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms