Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ttc21bQ0HA38 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms