Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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