Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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