Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RxraP28700 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms