Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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