Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vpreb2P13373 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms