Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms