Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt85Q9Z2T6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt85Q9Z2T6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms