Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms