Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms