Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms