Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccne2Q9Z238 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccne2Q9Z238 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms