Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms