Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr4Q9Z1L2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms