Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shcbp1Q9Z179 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms