Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms