Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xpr1Q9Z0U0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xpr1Q9Z0U0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms