Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms