Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme3Q9WV85 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms