Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms