Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfsf13bQ9WU72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms