Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skp1Q9WTX5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms