Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PplQ9R269 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PplQ9R269 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PplQ9R269 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PplQ9R269 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms